Sau Lượt chiến đấu, Người có lượt tiến vào Giai đoạn chính 2 (メインフェイズ2 Meinfeizu Ni). Trong lượt này, mỗi hoạt động mà bình thường có thể thực hiện ở Giai đoạn Chính 1 có thể làm, miễn là đạt yêu cầu ( tức là không quá 1 lần Triệu hồi Thường hoặc Úp bài).
Trong Giai đoạn chính 2, Người có lượt có thể:
- Triệu hồi Thường, Triệu hồi Hi sinh, hoặc Úp một quái thú Nếu bạn chưa làm trong Giai đoạn chính 1.
- Triệu hồi Đặc biệt quái thú.
- Tự thay đổi Tư thế chiến đấu của quái thú, miễn là quái thú đó không tuyên bố tấn công trong Lượt chiến đấu, và miễn là nó không bị Úp, Triệu hồi Thường, Triệu hồi Lật mặt, hoặc Triệu hồi Đặc biệt trong lượt này.
- Thực hiện Triệu hồi Lật mặt đối với Bài Quái thú, miễn là nó không bị Úp hoặc Triệu hồi ở Giai đoạn chính 1.
- Hoạt động hiệu ứng, như "Barrel Dragon" hoặc "Blowback Dragon" nếu chúng chưa hoạt động ở Giai đoạn chính 1.
- Hoạt động hiệu ứng như "Cannon Soldier" loại hiệu ứng mà chỉ hoạt động ở Giai đoạn chính, nhưng không thể dùng nhiều hơn một lần trong lượt.
- Hoạt động hoặc úp Bài Phép và/hoặc Bài bẫy với bất kỳ mức phép. Bài Phép Tức thời và Bài bẫy không được hoạt động trong lượt chúng Úp.
Nếu một số quái thú đặc biệt không được Triệu hồi trong lượt này, Người có lượt có thể lập ÚP xuống bằng cách dùng hiệu ứng của nó (giống như với "Guardian Sphinx" hoặc "Swarm of Scarabs"), và đồng thời có thể thực hiện Triệu hồi Lật mặt lên nó, do luật nói rằng Tư thế chiến đấu có thể chuyển đổi mỗi lần một lượt.
Chỉ có những lá bài sau đây có thể bỏ qua lượt này là "Flashbang", "Terminal World" và "Cardcar D".