Cibler est l'acte de sélectionner quelles cartes sont affectées/utilisées par un effet de carte. Ces cartes sont ciblées à l'activation de l'effet ciblant. Ce terme est utilisé aussi pour sélectionner la cible d'une attaque. Les cartes comme "Trou Noir" ou "Raigeki" peuvent affecter une ou plusieurs cartes, mais n'en ciblent pas une.
Les cibles d'un effet doivent être déclarées avant qu'une carte puisse être activée en Chaîne. Les cibles doivent aussi se trouvées dans l'endroit spécifiée par l'effet (le Terrain, le Cimetière ou la Zone Bannie). Si la cible de l'effet est déplacée (depuis le Terrain au Cimetière, par exemple) avant la résolution de l'effet, la cible est invalidée, et l'effet résout sans effet.
Similairement, si la cible est changée en quelque chose que l'effet ne peut pas ciblée avant la résolution de l'effet (un monstre face recto étant retourné face verso quand l'effet ne peut cibler que les monstres face recto, par exemple), la cible est de nouveau invalidée, et l'effet résout sans effet.