Yu-Gi-Oh! Ultimate Masters: World Championship Tournament 2006, llamado Yu-Gi-Oh! Experto de Duelo Monstruos 2006 (遊戯 王 デュエル モンスターズ エキスパート 2006) en Japón, y Yu-Gi-Oh! World Championship 2006 en Europa, es un videojuego lanzado en el año 2006 basado en la franquicia Yu-Gi-Oh!. El juego consiste en que el jugador ha de coleccionar cartas en el juego y usarlas para luchar contra los personajes del videojuego. Los jugadores pueden también (después de completar el modo Duelo Libre) pelear contra Decks que ellos mismos hayan diseñado y guardado. Este juego viene con tres cartas promocionales, que son "Helios - El Sol Primordial", "Helios Dúo Megistus" y "Homúnculo Dorado".
Este juego contiene un total de 2080 de las cartas disponibles en el momento de su lanzamiento, con la excepción de "Hechizo Doble", "Coliseo del Kaiser", "Jefe del Cuidador de Tumbas", "Mi Cuerpo como Escudo", "Cañón Tras la Puerta", "Gaitero Dragón", "Primavera del Renacimiento", "Romper la Mente" y una gran cantidad de Monstruos Normales de Nivel 5. A diferencia de juegos anteriores, las cartas conseguidas en sobres tienen correlación directa con los sobres de expansión publicados para el TCG. Los jugadores pueden comprar sobres que van desde el Sobre de Expansión Leyenda del Dragón Blanco de Ojos Azules hasta el Sobre de Expansión Sombra del Infinito. También hay sobres especializados en temas concretos (Guerrero, Lanzador de Conjuros, Máquina, etc), e incluso según la clase de carta (Monstruos de Efecto, Monstruos Normales, Cartas Mágicas, Carta de Trampa). Los sobres adicionales se irán desbloqueando a medida que el jugador avanza en el juego. La carta del monstruo "HÉROE Elemental Neos" apareció en el juego antes de su lanzamiento.
Al igual que con los juegos anteriores, se pueden introducir contraseñas de cartas impresas en cartas del OCG/TCG con el fin de obtener una carta deseada en el juego. Ahora se puede obtener tantas copias de cada carta que quiera de esta manera (limitada a uno en los juegos anteriores, excepto Yu-Gi-Oh! El Día del Duelo: World Championship Tournament 2005), pero hay que pagar un coste fijo por cada carta, que oscilan entre unos pocos cientos de DP y 10.000 DP para cartas Prohibidas y Limitadas, como "Olla de la Codicia" y "Soldado del Brillo Negro - Enviado del Principio"
A diferencia de los videojuegos anteriores, en este los jugadores no se enfrentarán a personajes de las series manga y anime (y los Decks que estos usan). En su lugar, los adversarios serán "Monstruos de Duelo" (Ciber Dragón, Kuriboh, Mago Oscuro, etc.) Los monstruos se organizan en cinco niveles diferentes. El Duelo libre se basa en niveles (del 1 al 5) para desbloquear. También hay un nivel especial donde se puede tener Duelos contra el Deck que el jugador haya seleccionado e Imitador (que usa un Deck de tu elección de hasta 60 cartas).
Además, hay desafíos en el Duelo Libre. Estos consisten en "Puzzles de Duelo" (ganar un Duelo dadas ciertas cartas en el Campo y en la mano) y Duelos de Supervivencia (ver cuántos Duelos se puede ganar seguidos, con tus LP restantes trasladándose de Duelo en Duelo). A medida que el jugador complete ciertos porcentajes de retos, más paquetes y más Duelistas estarán desbloqueados. También puede actualizar la Lista de cartas prohibidas y limitadas a la actual en el sitio web de Yu-Gi-Oh!